Yoh, un garçon de treize ans, est l'héritier d'une longue lignée de Shamans et possède le don de communiquer avec l'au-delà. Aidé par Amidamaru, l'esprit fantôme d'un samouraï disparu, Yoh parcourt le monde pour combattre les esprits maléfiques et se prépare ainsi à devenir un jour "Shaman King", un titre suprême décerné tous les cinq cents ans.